Existen varias cepas del PepMV, como LP, EU, CH2 y US1. Algunas variantes pueden producir síntomas graves, como necrosis en el follaje y los tallos de la planta, y frutos reblandecidos, jaspeados o rajados que resultan invendibles. El grado de aparición de los síntomas depende de las características genéticas de la cepa del virus y de otros factores como el clima, la nutrición y el estado de la planta.
El PepMV es inofensivo para las personas y los animales, pero afecta a las tomateras. Los frutos contaminados se pueden consumir sin riesgo.
Al transmitirse la savia de una planta infectada a otra sana, la segunda puede infectarse también. Otras vías de contagio son los objetos que hayan estado en contacto con cultivos infectados, como la ropa o los teléfonos. Si una planta de un invernadero se contagia del PepMV, se lo transmitirá a las demás.
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